Madrasah Baitunnisa Ar Rahimiyah menawarkan dua program pendidikan utama yang direka untuk memperdalam ilmu agama dalam kalangan pelajar wanita: Kelas Pengajian Kitab dan Kelas Pengajian Tahfiz. Setiap program disusun dengan kurikulum yang komprehensif dan bertujuan melahirkan generasi yang bukan sahaja memahami tetapi juga mengamalkan ajaran Islam dengan sepenuh hati.